המוזיאון מוקדש לסיפור המאבק על זכותו של העם היהודי לעלות לארץ-ישראל, למבצעי ההעפלה ולסיפור הקמת הכוח הימי שלימים הפך לזרוע הים.
פרשת מאבק המעפילים והיישוב, שהיתה אחת מאבני הדרך בהקמת המדינה, מוצגת במסמכים היסטוריים, קטעי עיתונות, צילומים, דגמים וחזיונות אור-קוליים וניתן לעקוב אחרי דרכן של אוניות ההעפלה השונות ארצה ולשמוע על סיפורן באמצעות מפה ממוחשבת וייחודית.

אחד המיצגים המיוחדים הנוספים הקיימים במוזיאון היא אוניית המעפילים המקורית "אף על פי כן" המוצבת במוזיאון.
המוזיאון מציג גם את סיפור הקמתה של זרוע הים מימי השירות הימי ועד היום בתצוגה מיוחדת בה הציבור יכול להיחשף למסמכים, צילומים ומוצגים היסטוריים כדוגמת תעודות, תרשימי קרב, דגמי אניות, נשק ואמצעי לחימה ימיים.

ספינת הטילים אח"י מבטח והצוללת אח"י גל מוצבות במוזיאון ופתוחות לסיורי הקהל.

מוזיאון חיל הים וההעפלה 
חיפה, דרך אלנבי 204 מיקוד : 35472
טלפון: 04-8536249
פקס: 04-8512958
דוא"ל: haapala.mus@gmail.com
שעות פעילות:
ימים א' - ה' 16:00 - 10:00